<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xml:lang="ru" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:noNamespaceSchemaLocation="https://metafora.rcsi.science/xsd_files/journal3.xsd">
  <front>
    <journal-meta>
      <journal-id journal-id-type="publisher-id">moitvivt</journal-id>
      <journal-title-group>
        <journal-title xml:lang="ru">Моделирование, оптимизация и информационные технологии</journal-title>
        <trans-title-group xml:lang="en">
          <trans-title>Modeling, Optimization and Information Technology</trans-title>
        </trans-title-group>
      </journal-title-group>
      <issn pub-type="epub">2310-6018</issn>
      <publisher>
        <publisher-name>Издательство</publisher-name>
      </publisher>
    </journal-meta>
    <article-meta>
      <article-id pub-id-type="doi">10.26102/2310-6018/2024.47.4.008</article-id>
      <article-id pub-id-type="custom" custom-type="elpub">1715</article-id>
      <title-group>
        <article-title xml:lang="ru">Использование топологических скелетов для коррекции артефактов объемного движения в оптической когерентной томографии и эластографии</article-title>
        <trans-title-group xml:lang="en">
          <trans-title>Topological skeletons-based correction of volumetric motion artifacts in optical coherence tomography and elastography</trans-title>
        </trans-title-group>
      </title-group>
      <contrib-group>
        <contrib contrib-type="author">
          <contrib-id contrib-id-type="orcid">0000-0001-9376-3688</contrib-id>
          <name-alternatives>
            <name name-style="eastern" xml:lang="ru">
              <surname>Потлов</surname>
              <given-names>Антон Юрьевич</given-names>
            </name>
            <name name-style="western" xml:lang="en">
              <surname>Potlov</surname>
              <given-names>Anton Yurievich</given-names>
            </name>
          </name-alternatives>
          <email>zerner@yandex.ru</email>
          <xref ref-type="aff">aff-1</xref>
        </contrib>
      </contrib-group>
      <aff-alternatives id="aff-1">
        <aff xml:lang="ru">Тамбовский государственный технический университет</aff>
        <aff xml:lang="en">Tambov State Technical University</aff>
      </aff-alternatives>
      <pub-date pub-type="epub">
        <day>01</day>
        <month>01</month>
        <year>2026</year>
      </pub-date>
      <volume>1</volume>
      <issue>1</issue>
      <elocation-id>10.26102/2310-6018/2024.47.4.008</elocation-id>
      <permissions>
        <copyright-statement>Copyright © Авторы, 2026</copyright-statement>
        <copyright-year>2026</copyright-year>
        <license license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/">
          <license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License</license-p>
        </license>
      </permissions>
      <self-uri xlink:href="https://moitvivt.ru/ru/journal/article?id=1715"/>
      <abstract xml:lang="ru">
        <p>В работе представлен оригинальный подход к стабилизации изображений при оптической когерентной томографии и эластографии. Ключевыми отличительными особенностями предложенного подхода являются: I) бинаризация и использование операций математической морфологии; II) параллельное построение топологического скелета для каждого оптического изображения с акцентом на эквивалентный сигнал высокого и низкого уровней; III) комплексирование топологических скелетов; IV) сравнение последовательности оптических изображений по объединенным топологическим скелетам с использованием точек «квенча»; V) компенсация артефактов объемного движения посредством «пересборки» исходных совокупностей интерференционных сигналов. Вычислительная эффективность предложенного метода относительно динамики сбора интерференционных сигналов конкретным прибором была достигнута посредством использования последовательно и параллельно выполняемых операций. При этом комбинировались вычисления на центральном и графических процессорах, то есть GPU и CPU. Высокая эффективность коррекции артефактов объемного движения в оптической когерентной томографии и эластографии обеспечена за счет робастности топологических скелетов, построенных с акцентом на эквивалентный сигнал высокого уровня к спекл-шумам, соответствующим конструктивному характеру интерференции (яркие спеклы), и соответственно робастности топологических скелетов для эквивалентного сигнала низкого уровня к темным спеклам (деструктивный характер интерференции).</p>
      </abstract>
      <trans-abstract xml:lang="en">
        <p>An original approach to image stabilization in optical coherence tomography and elastography was presented. The key features of the proposed approach are: I) binarization and application of mathematical morphology digital operations; II) parallel construction of a topological skeleton for each optical image with an emphasis on the equivalent high- and low-level signal; III) complexing of topological skeletons; IV) comparison of a sequence of optical images by combined topological skeletons using «quench» points; V) compensation of volumetric motion artifacts by «reassembling» the original sets of interference signals. The computational efficiency of the proposed method with respect to the dynamics of interference signal acquisition by a specific device was achieved by using sequential and parallel operations. Сomputations using the central and graphical processing units, namely GPU and CPU, were combined for this. High efficiency of volumetric motion artifact correction in optical coherence tomography and elastography is ensured by robustness of topological skeletons constructed with emphasis on high-level equivalent signal to speckle noise corresponding to constructive interference (bright speckles). Topological skeletons for low-level equivalent signal are correspondingly robust to dark speckles (destructive interference result).</p>
      </trans-abstract>
      <kwd-group xml:lang="ru">
        <kwd>оптическая когерентная томография</kwd>
        <kwd>медицинская эластография</kwd>
        <kwd>волоконно-оптический зонд</kwd>
        <kwd>структурные изображения</kwd>
        <kwd>функциональные изображения</kwd>
        <kwd>топологический скелет</kwd>
        <kwd>биологические ткани</kwd>
        <kwd>тканеимитирующие фантомы</kwd>
        <kwd>артефакты объемного движения</kwd>
      </kwd-group>
      <kwd-group xml:lang="en">
        <kwd>optical coherence tomography</kwd>
        <kwd>medical elastography</kwd>
        <kwd>fiber optic probe</kwd>
        <kwd>structural images</kwd>
        <kwd>functional images</kwd>
        <kwd>topological skeleton</kwd>
        <kwd>biological tissue</kwd>
        <kwd>tissue-imitating phantoms</kwd>
        <kwd>volumetric motion artifacts</kwd>
      </kwd-group>
      <funding-group>
        <funding-statement xml:lang="ru">Исследование выполнено при финансовой поддержке Совета по грантам Президента Российской Федерации (проект МК-231.2022.4).</funding-statement>
        <funding-statement xml:lang="en">This work was supported by Council for Grants of the President of the Russian Federation (project MK-231.2022.4).</funding-statement>
      </funding-group>
    </article-meta>
  </front>
  <back>
    <ref-list>
      <title>References</title>
      <ref id="cit1">
        <label>1</label>
        <mixed-citation xml:lang="ru">Moiseev A.A., Ksenofontov S.Yu., Terpelov D.A., Kiseleva E.B., Yashin K.S., Sirotkina M.A., Gladkova N.D., Gelikonov G.V. Optical Coherence Angiography without Motion Correction Preprocessing. Laser Physics Letters. 2019;16(4). https://doi.org/10.1088/1612-202X/aaf996</mixed-citation>
      </ref>
      <ref id="cit2">
        <label>2</label>
        <mixed-citation xml:lang="ru">Liu X., Hubbi B., Zhou X. Spatial Coordinate Corrected Motion Tracking for Optical Coherence Elastography. Biomedical Optics Express. 2019;10(12):6160–6171. https://doi.org/10.1364/BOE.10.006160</mixed-citation>
      </ref>
      <ref id="cit3">
        <label>3</label>
        <mixed-citation xml:lang="ru">Фролов С.В., Потлов А.Ю. Система эндоскопической оптической когерентной томографии с повышенной точностью позиционирования катетера. Медицинская техника. 2019;(1):5–8.</mixed-citation>
      </ref>
      <ref id="cit4">
        <label>4</label>
        <mixed-citation xml:lang="ru">Krajancich B., Curatolo A., Fang Q., Zilkens R., Dessauvagie B.F., Saunders C.M., Kennedy B.F. Handheld Optical Palpation of Turbid Tissue with Motion-Artifact Correction. Biomedical Optics Express. 2019;10(1):226–241. https://doi.org/10.1364/BOE.10.000226</mixed-citation>
      </ref>
      <ref id="cit5">
        <label>5</label>
        <mixed-citation xml:lang="ru">Hepburn M.S., Foo K.Y., Wijesinghe P., Munro P.R.T., Chin L., Kennedy B.F. Speckle-Dependent Accuracy in Phase-Sensitive Optical Coherence Tomography. Optics Express. 2021;29(11):16950–16968. https://doi.org/10.1364/OE.417954</mixed-citation>
      </ref>
      <ref id="cit6">
        <label>6</label>
        <mixed-citation xml:lang="ru">Parmar A., Singh K. Motion-Artifact-Free Single Shot Two-Beam Optical Coherence Elastography System. Journal of Biomedical Optics. 2024;29(2). https://doi.org/10.1117/1.jbo.29.2.025003</mixed-citation>
      </ref>
      <ref id="cit7">
        <label>7</label>
        <mixed-citation xml:lang="ru">Gong Z., Johnstone M.A., Wang R.K. iStent Insertion Orientation and Impact on Trabecular Meshwork Motion Resolved by Optical Coherence Tomography Imaging. Journal of Biomedical Optics. 2024;29(7). https://doi.org/10.1117/1.JBO.29.7.076008</mixed-citation>
      </ref>
      <ref id="cit8">
        <label>8</label>
        <mixed-citation xml:lang="ru">Wagner J., Robledo L., Pezold S., Eggenschwiler L., Hasler P., Goldblum D., Cattin P.C. Model-Based Motion Compensation for Corneal Topography by Optical Coherence Tomography. OSA Continuum. 2020;3(7):1967–1987. https://doi.org/10.1364/OSAC.389898</mixed-citation>
      </ref>
      <ref id="cit9">
        <label>9</label>
        <mixed-citation xml:lang="ru">Ploner S.B., Kraus M.F., Moult E.M., Husvogt L., Schottenhamml J., Alibhai A.Y., Waheed N.K., Duker J.S., Fujimoto J.G., Maier A.K. Efficient and High Accuracy 3-D OCT Angiography Motion Correction in Pathology. Biomedical Optics Express. 2021;12(1):125–146. https://doi.org/10.1364/BOE.411117</mixed-citation>
      </ref>
      <ref id="cit10">
        <label>10</label>
        <mixed-citation xml:lang="ru">Potlov A., Frolov S., Proskurin S. Features of Diffuse Photon Migration in Soft Biological Tissue. In: Journal of Physics: Conference Series: Volume 1084: 4th International Scientific and Practical Conference on Virtual Simulation, Prototyping and Industrial Design 2017, VSPID 2017, 15–17 November 2017, Tambov, Russia. Institute of Physics Publishing; 2018. https://doi.org/10.1088/1742-6596/1084/1/012012</mixed-citation>
      </ref>
      <ref id="cit11">
        <label>11</label>
        <mixed-citation xml:lang="ru">Bashkatov A.N., Genina E.A., Kochubey V.I., Tuchin V.V. Quantification of Tissue Optical Properties: Perspectives for Precise Optical Diagnostics, Phototherapy and Laser Surgery. Journal of Physics D: Applied Physics. 2016;49(50). https://doi.org/10.1088/0022-3727/49/50/501001</mixed-citation>
      </ref>
      <ref id="cit12">
        <label>12</label>
        <mixed-citation xml:lang="ru">Sirotkina M.A., Gubarkova E.V., Plekhanov A.A., Sovetsky A.A., Elagin V.V., Matveyev A.L., Matveev L.A., Kuznetsov S.S., Zagaynova E.V., Gladkova N.D., Zaitsev V.Y. In vivo Assessment of Functional and Morphological Alterations in Tumors under Treatment using OCT-Angiography Combined with OCT-Elastography. Biomedical Optics Express. 2020;11(3):1365–1382. https://doi.org/10.1364/BOE.386419</mixed-citation>
      </ref>
      <ref id="cit13">
        <label>13</label>
        <mixed-citation xml:lang="ru">Frolov S.V., Sindeev S.V., Liepsch D., Balasso A., Arnold P., Kirschke J.S., Prothmann S., Potlov A.Yu. Newtonian and non-Newtonian blood flow at a 90º bifurcation of the cerebral artery: a comparative study of fluid viscosity models. Journal of Mechanics in Medicine and Biology. 2018;18(5). https://doi.org/10.1142/S0219519418500434</mixed-citation>
      </ref>
      <ref id="cit14">
        <label>14</label>
        <mixed-citation xml:lang="ru">Потлов А.Ю. Фрактальный подход к численному моделированию фотонного транспорта в биологических тканях на основе метода статистических испытаний Монте-Карло. Моделирование, оптимизация и информационные технологии. 2024;12(3). https://doi.org/10.26102/2310-6018/2024.46.3.022</mixed-citation>
      </ref>
    </ref-list>
    <fn-group>
      <fn fn-type="conflict">
        <p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p>
      </fn>
    </fn-group>
  </back>
</article>